Protein–RNA interactions for Protein: P62331

Arf6, ADP-ribosylation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf6P62331 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arf6P62331 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arf6P62331 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Arf6P62331 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arf6P62331 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arf6P62331 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arf6P62331 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arf6P62331 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arf6P62331 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arf6P62331 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arf6P62331 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf6P62331 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf6P62331 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Arf6P62331 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Arf6P62331 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Arf6P62331 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf6P62331 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf6P62331 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf6P62331 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf6P62331 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf6P62331 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf6P62331 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf6P62331 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf6P62331 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms