Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copz1P61924 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copz1P61924 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Copz1P61924 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Copz1P61924 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copz1P61924 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copz1P61924 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Copz1P61924 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Copz1P61924 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms