Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Polr2fP61219 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Polr2fP61219 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Polr2fP61219 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Polr2fP61219 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Polr2fP61219 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Polr2fP61219 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Polr2fP61219 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms