Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sem1P60897 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sem1P60897 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sem1P60897 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sem1P60897 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sem1P60897 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sem1P60897 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sem1P60897 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sem1P60897 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sem1P60897 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sem1P60897 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sem1P60897 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sem1P60897 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sem1P60897 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sem1P60897 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sem1P60897 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sem1P60897 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sem1P60897 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sem1P60897 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sem1P60897 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sem1P60897 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sem1P60897 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sem1P60897 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sem1P60897 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sem1P60897 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sem1P60897 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sem1P60897 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sem1P60897 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sem1P60897 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sem1P60897 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sem1P60897 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms