Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfia3P60469 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms