Protein–RNA interactions for Protein: P58682

Tlr8, Toll-like receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr8P58682 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tlr8P58682 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Tlr8P58682 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tlr8P58682 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlr8P58682 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlr8P58682 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlr8P58682 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlr8P58682 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlr8P58682 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlr8P58682 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlr8P58682 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlr8P58682 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlr8P58682 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlr8P58682 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlr8P58682 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlr8P58682 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlr8P58682 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlr8P58682 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tlr8P58682 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tlr8P58682 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tlr8P58682 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tlr8P58682 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tlr8P58682 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tlr8P58682 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tlr8P58682 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tlr8P58682 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tlr8P58682 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tlr8P58682 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tlr8P58682 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tlr8P58682 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tlr8P58682 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tlr8P58682 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tlr8P58682 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tlr8P58682 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tlr8P58682 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tlr8P58682 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tlr8P58682 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tlr8P58682 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tlr8P58682 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tlr8P58682 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tlr8P58682 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms