Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Setd4P58467 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Setd4P58467 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Setd4P58467 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Setd4P58467 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Setd4P58467 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Setd4P58467 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Setd4P58467 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Setd4P58467 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Setd4P58467 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Setd4P58467 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms