Protein–RNA interactions for Protein: P56959

Fus, RNA-binding protein FUS, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FusP56959 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FusP56959 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FusP56959 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FusP56959 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FusP56959 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FusP56959 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FusP56959 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FusP56959 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FusP56959 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FusP56959 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FusP56959 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FusP56959 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FusP56959 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FusP56959 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FusP56959 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FusP56959 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FusP56959 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FusP56959 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FusP56959 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FusP56959 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FusP56959 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FusP56959 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FusP56959 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FusP56959 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FusP56959 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FusP56959 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FusP56959 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FusP56959 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FusP56959 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FusP56959 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FusP56959 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FusP56959 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FusP56959 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FusP56959 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FusP56959 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FusP56959 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FusP56959 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FusP56959 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FusP56959 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FusP56959 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FusP56959 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FusP56959 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FusP56959 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FusP56959 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FusP56959 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FusP56959 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FusP56959 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FusP56959 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FusP56959 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FusP56959 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FusP56959 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FusP56959 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FusP56959 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FusP56959 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FusP56959 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FusP56959 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FusP56959 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FusP56959 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FusP56959 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FusP56959 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FusP56959 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FusP56959 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FusP56959 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FusP56959 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FusP56959 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FusP56959 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FusP56959 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FusP56959 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FusP56959 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FusP56959 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FusP56959 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FusP56959 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FusP56959 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FusP56959 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FusP56959 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FusP56959 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FusP56959 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FusP56959 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FusP56959 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FusP56959 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FusP56959 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FusP56959 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FusP56959 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FusP56959 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FusP56959 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FusP56959 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FusP56959 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FusP56959 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FusP56959 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FusP56959 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FusP56959 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FusP56959 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FusP56959 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FusP56959 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FusP56959 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FusP56959 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FusP56959 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FusP56959 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FusP56959 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FusP56959 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms