Protein–RNA interactions for Protein: P56942

Pmch, Pro-MCH, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmchP56942 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmchP56942 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmchP56942 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmchP56942 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmchP56942 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmchP56942 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmchP56942 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmchP56942 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmchP56942 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmchP56942 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmchP56942 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmchP56942 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmchP56942 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmchP56942 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PmchP56942 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PmchP56942 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PmchP56942 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PmchP56942 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PmchP56942 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PmchP56942 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PmchP56942 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PmchP56942 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PmchP56942 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PmchP56942 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PmchP56942 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PmchP56942 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PmchP56942 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PmchP56942 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PmchP56942 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PmchP56942 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmchP56942 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmchP56942 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PmchP56942 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmchP56942 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmchP56942 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmchP56942 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmchP56942 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmchP56942 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmchP56942 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmchP56942 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmchP56942 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmchP56942 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmchP56942 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmchP56942 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmchP56942 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmchP56942 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PmchP56942 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmchP56942 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PmchP56942 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmchP56942 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmchP56942 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmchP56942 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmchP56942 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmchP56942 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmchP56942 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmchP56942 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmchP56942 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmchP56942 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PmchP56942 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PmchP56942 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PmchP56942 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PmchP56942 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PmchP56942 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PmchP56942 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PmchP56942 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PmchP56942 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PmchP56942 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PmchP56942 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PmchP56942 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PmchP56942 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PmchP56942 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PmchP56942 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PmchP56942 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PmchP56942 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PmchP56942 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PmchP56942 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PmchP56942 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PmchP56942 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PmchP56942 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PmchP56942 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PmchP56942 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PmchP56942 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PmchP56942 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PmchP56942 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PmchP56942 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PmchP56942 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PmchP56942 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PmchP56942 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PmchP56942 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PmchP56942 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PmchP56942 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PmchP56942 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PmchP56942 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PmchP56942 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PmchP56942 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PmchP56942 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PmchP56942 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PmchP56942 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PmchP56942 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PmchP56942 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms