Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab4aP56371 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab4aP56371 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab4aP56371 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab4aP56371 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab4aP56371 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab4aP56371 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab4aP56371 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab4aP56371 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab4aP56371 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab4aP56371 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab4aP56371 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab4aP56371 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab4aP56371 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab4aP56371 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab4aP56371 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab4aP56371 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab4aP56371 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab4aP56371 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab4aP56371 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab4aP56371 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab4aP56371 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab4aP56371 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab4aP56371 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab4aP56371 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab4aP56371 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab4aP56371 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab4aP56371 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab4aP56371 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab4aP56371 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab4aP56371 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab4aP56371 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab4aP56371 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab4aP56371 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab4aP56371 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab4aP56371 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab4aP56371 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab4aP56371 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab4aP56371 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab4aP56371 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab4aP56371 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab4aP56371 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab4aP56371 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab4aP56371 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab4aP56371 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab4aP56371 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab4aP56371 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab4aP56371 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab4aP56371 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab4aP56371 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab4aP56371 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab4aP56371 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab4aP56371 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab4aP56371 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab4aP56371 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab4aP56371 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab4aP56371 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab4aP56371 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab4aP56371 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab4aP56371 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab4aP56371 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab4aP56371 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab4aP56371 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab4aP56371 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab4aP56371 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab4aP56371 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab4aP56371 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab4aP56371 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab4aP56371 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab4aP56371 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab4aP56371 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab4aP56371 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab4aP56371 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab4aP56371 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab4aP56371 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab4aP56371 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab4aP56371 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab4aP56371 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab4aP56371 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab4aP56371 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab4aP56371 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab4aP56371 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rab4aP56371 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab4aP56371 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rab4aP56371 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab4aP56371 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Rab4aP56371 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab4aP56371 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rab4aP56371 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab4aP56371 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab4aP56371 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab4aP56371 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab4aP56371 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab4aP56371 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab4aP56371 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab4aP56371 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab4aP56371 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab4aP56371 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab4aP56371 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rab4aP56371 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms