Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ephb3P54754 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms