Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad23bP54728 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rad23bP54728 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms