Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad23aP54726 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms