Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacnb3P54285 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cacnb3P54285 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms