Protein–RNA interactions for Protein: P53994

Rab2a, Ras-related protein Rab-2A, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2aP53994 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab2aP53994 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms