Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PctpP53808 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PctpP53808 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PctpP53808 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PctpP53808 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PctpP53808 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PctpP53808 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PctpP53808 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PctpP53808 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PctpP53808 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PctpP53808 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PctpP53808 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PctpP53808 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PctpP53808 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PctpP53808 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PctpP53808 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PctpP53808 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PctpP53808 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PctpP53808 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PctpP53808 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PctpP53808 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PctpP53808 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PctpP53808 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PctpP53808 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PctpP53808 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PctpP53808 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PctpP53808 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PctpP53808 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PctpP53808 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PctpP53808 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PctpP53808 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PctpP53808 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PctpP53808 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PctpP53808 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PctpP53808 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PctpP53808 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PctpP53808 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PctpP53808 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PctpP53808 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PctpP53808 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PctpP53808 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PctpP53808 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PctpP53808 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PctpP53808 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PctpP53808 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PctpP53808 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PctpP53808 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PctpP53808 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PctpP53808 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PctpP53808 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PctpP53808 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PctpP53808 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PctpP53808 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PctpP53808 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PctpP53808 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PctpP53808 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PctpP53808 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PctpP53808 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PctpP53808 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PctpP53808 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PctpP53808 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PctpP53808 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PctpP53808 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PctpP53808 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PctpP53808 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PctpP53808 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PctpP53808 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PctpP53808 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PctpP53808 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PctpP53808 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PctpP53808 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PctpP53808 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PctpP53808 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PctpP53808 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PctpP53808 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PctpP53808 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PctpP53808 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PctpP53808 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PctpP53808 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PctpP53808 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PctpP53808 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PctpP53808 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PctpP53808 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PctpP53808 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PctpP53808 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PctpP53808 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PctpP53808 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PctpP53808 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PctpP53808 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PctpP53808 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PctpP53808 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PctpP53808 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PctpP53808 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PctpP53808 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PctpP53808 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PctpP53808 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PctpP53808 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PctpP53808 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PctpP53808 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PctpP53808 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms