Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms