Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Map3k1P53349 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Map3k1P53349 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Map3k1P53349 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Map3k1P53349 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Map3k1P53349 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Map3k1P53349 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Map3k1P53349 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Map3k1P53349 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Map3k1P53349 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms