Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FmodP50608 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FmodP50608 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FmodP50608 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FmodP50608 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FmodP50608 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FmodP50608 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FmodP50608 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FmodP50608 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FmodP50608 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FmodP50608 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FmodP50608 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FmodP50608 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FmodP50608 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FmodP50608 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FmodP50608 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FmodP50608 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FmodP50608 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FmodP50608 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FmodP50608 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FmodP50608 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FmodP50608 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FmodP50608 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FmodP50608 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FmodP50608 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FmodP50608 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FmodP50608 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FmodP50608 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FmodP50608 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FmodP50608 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FmodP50608 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FmodP50608 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FmodP50608 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FmodP50608 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FmodP50608 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FmodP50608 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FmodP50608 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FmodP50608 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FmodP50608 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FmodP50608 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FmodP50608 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FmodP50608 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FmodP50608 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FmodP50608 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FmodP50608 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FmodP50608 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FmodP50608 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FmodP50608 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FmodP50608 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FmodP50608 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FmodP50608 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FmodP50608 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FmodP50608 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FmodP50608 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FmodP50608 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FmodP50608 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FmodP50608 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FmodP50608 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FmodP50608 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FmodP50608 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FmodP50608 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FmodP50608 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FmodP50608 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FmodP50608 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FmodP50608 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FmodP50608 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FmodP50608 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FmodP50608 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FmodP50608 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FmodP50608 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FmodP50608 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FmodP50608 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FmodP50608 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FmodP50608 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FmodP50608 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FmodP50608 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FmodP50608 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FmodP50608 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FmodP50608 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FmodP50608 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FmodP50608 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FmodP50608 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FmodP50608 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FmodP50608 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FmodP50608 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FmodP50608 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FmodP50608 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FmodP50608 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FmodP50608 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FmodP50608 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FmodP50608 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FmodP50608 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FmodP50608 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FmodP50608 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FmodP50608 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FmodP50608 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FmodP50608 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FmodP50608 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FmodP50608 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FmodP50608 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms