Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LtbrP50284 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LtbrP50284 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LtbrP50284 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LtbrP50284 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LtbrP50284 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LtbrP50284 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LtbrP50284 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LtbrP50284 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LtbrP50284 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LtbrP50284 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LtbrP50284 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms