Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms