Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtpreP49446 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtpreP49446 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtpreP49446 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtpreP49446 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PtpreP49446 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtpreP49446 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtpreP49446 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtpreP49446 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtpreP49446 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PtpreP49446 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
PtpreP49446 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PtpreP49446 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PtpreP49446 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PtpreP49446 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PtpreP49446 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtpreP49446 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PtpreP49446 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PtpreP49446 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtpreP49446 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtpreP49446 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PtpreP49446 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtpreP49446 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtpreP49446 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PtpreP49446 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtpreP49446 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtpreP49446 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PtpreP49446 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PtpreP49446 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtpreP49446 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtpreP49446 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtpreP49446 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtpreP49446 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PtpreP49446 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PtpreP49446 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PtpreP49446 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtpreP49446 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PtpreP49446 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtpreP49446 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtpreP49446 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PtpreP49446 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtpreP49446 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PtpreP49446 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtpreP49446 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PtpreP49446 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtpreP49446 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PtpreP49446 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PtpreP49446 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PtpreP49446 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtpreP49446 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PtpreP49446 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PtpreP49446 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtpreP49446 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtpreP49446 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtpreP49446 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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