Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HpdP49429 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HpdP49429 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HpdP49429 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HpdP49429 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HpdP49429 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HpdP49429 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HpdP49429 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HpdP49429 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HpdP49429 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HpdP49429 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HpdP49429 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HpdP49429 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HpdP49429 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HpdP49429 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HpdP49429 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HpdP49429 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HpdP49429 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HpdP49429 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HpdP49429 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HpdP49429 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HpdP49429 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HpdP49429 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HpdP49429 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HpdP49429 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HpdP49429 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HpdP49429 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HpdP49429 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HpdP49429 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HpdP49429 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HpdP49429 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HpdP49429 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HpdP49429 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HpdP49429 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HpdP49429 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HpdP49429 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HpdP49429 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HpdP49429 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HpdP49429 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HpdP49429 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HpdP49429 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HpdP49429 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HpdP49429 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HpdP49429 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HpdP49429 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HpdP49429 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HpdP49429 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HpdP49429 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HpdP49429 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HpdP49429 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HpdP49429 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HpdP49429 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HpdP49429 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HpdP49429 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HpdP49429 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HpdP49429 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HpdP49429 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HpdP49429 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HpdP49429 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HpdP49429 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HpdP49429 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HpdP49429 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HpdP49429 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HpdP49429 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HpdP49429 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HpdP49429 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HpdP49429 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HpdP49429 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HpdP49429 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HpdP49429 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HpdP49429 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HpdP49429 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HpdP49429 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HpdP49429 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HpdP49429 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HpdP49429 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HpdP49429 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HpdP49429 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HpdP49429 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HpdP49429 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HpdP49429 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HpdP49429 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HpdP49429 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HpdP49429 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HpdP49429 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HpdP49429 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HpdP49429 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HpdP49429 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HpdP49429 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HpdP49429 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HpdP49429 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HpdP49429 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HpdP49429 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HpdP49429 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HpdP49429 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HpdP49429 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HpdP49429 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HpdP49429 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HpdP49429 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HpdP49429 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms