Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ercc3P49135 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ercc3P49135 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms