Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Abcd1P48410 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Abcd1P48410 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms