Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TgfaP48030 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TgfaP48030 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TgfaP48030 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TgfaP48030 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
TgfaP48030 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TgfaP48030 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TgfaP48030 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TgfaP48030 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TgfaP48030 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TgfaP48030 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TgfaP48030 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TgfaP48030 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TgfaP48030 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TgfaP48030 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TgfaP48030 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TgfaP48030 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TgfaP48030 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TgfaP48030 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TgfaP48030 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TgfaP48030 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TgfaP48030 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TgfaP48030 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TgfaP48030 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TgfaP48030 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TgfaP48030 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TgfaP48030 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TgfaP48030 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TgfaP48030 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TgfaP48030 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TgfaP48030 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TgfaP48030 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TgfaP48030 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TgfaP48030 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TgfaP48030 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TgfaP48030 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TgfaP48030 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TgfaP48030 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TgfaP48030 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TgfaP48030 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms