Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gli1P47806 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gli1P47806 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gli1P47806 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gli1P47806 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gli1P47806 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gli1P47806 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms