Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pax7P47239 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pax7P47239 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax7P47239 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pax7P47239 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax7P47239 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax7P47239 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms