Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Syt1P46096 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syt1P46096 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syt1P46096 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syt1P46096 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Syt1P46096 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Syt1P46096 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Syt1P46096 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Syt1P46096 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Syt1P46096 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Syt1P46096 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syt1P46096 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syt1P46096 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syt1P46096 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Syt1P46096 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syt1P46096 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syt1P46096 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Syt1P46096 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syt1P46096 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Syt1P46096 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syt1P46096 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms