Protein–RNA interactions for Protein: P43252

Ptgir, Prostacyclin receptor, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgirP43252 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgirP43252 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgirP43252 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtgirP43252 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtgirP43252 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PtgirP43252 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PtgirP43252 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgirP43252 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgirP43252 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgirP43252 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgirP43252 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgirP43252 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgirP43252 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgirP43252 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgirP43252 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgirP43252 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgirP43252 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgirP43252 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgirP43252 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgirP43252 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgirP43252 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgirP43252 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtgirP43252 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms