Protein–RNA interactions for Protein: P42581

Hmx3, Homeobox protein HMX3, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx3P42581 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hmx3P42581 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmx3P42581 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmx3P42581 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmx3P42581 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmx3P42581 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmx3P42581 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmx3P42581 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmx3P42581 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmx3P42581 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmx3P42581 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmx3P42581 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmx3P42581 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmx3P42581 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmx3P42581 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hmx3P42581 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmx3P42581 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms