Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp9P41245 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Mmp9P41245 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Mmp9P41245 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp9P41245 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Mmp9P41245 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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