Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col18a1P39061 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Col18a1P39061 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col18a1P39061 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col18a1P39061 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col18a1P39061 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col18a1P39061 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms