Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lig1P37913 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lig1P37913 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Lig1P37913 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lig1P37913 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lig1P37913 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lig1P37913 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lig1P37913 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lig1P37913 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lig1P37913 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lig1P37913 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Lig1P37913 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms