Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tfap2aP34056 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tfap2aP34056 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tfap2aP34056 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tfap2aP34056 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tfap2aP34056 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tfap2aP34056 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tfap2aP34056 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tfap2aP34056 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tfap2aP34056 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tfap2aP34056 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tfap2aP34056 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tfap2aP34056 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tfap2aP34056 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tfap2aP34056 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tfap2aP34056 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tfap2aP34056 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tfap2aP34056 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tfap2aP34056 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tfap2aP34056 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tfap2aP34056 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tfap2aP34056 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tfap2aP34056 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tfap2aP34056 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms