Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd28P31041 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd28P31041 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd28P31041 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd28P31041 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd28P31041 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd28P31041 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cd28P31041 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd28P31041 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd28P31041 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd28P31041 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd28P31041 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
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