Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc6a9P28571 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a9P28571 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms