Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Col2a1P28481 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col2a1P28481 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col2a1P28481 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms