Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd9P28357 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxd9P28357 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms