Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Etv4P28322 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Etv4P28322 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Etv4P28322 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Etv4P28322 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms