Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LoxP28301 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LoxP28301 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LoxP28301 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LoxP28301 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LoxP28301 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LoxP28301 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LoxP28301 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LoxP28301 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LoxP28301 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LoxP28301 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LoxP28301 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LoxP28301 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LoxP28301 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LoxP28301 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LoxP28301 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LoxP28301 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LoxP28301 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LoxP28301 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LoxP28301 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LoxP28301 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LoxP28301 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LoxP28301 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LoxP28301 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LoxP28301 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LoxP28301 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LoxP28301 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LoxP28301 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LoxP28301 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LoxP28301 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LoxP28301 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LoxP28301 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LoxP28301 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LoxP28301 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LoxP28301 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LoxP28301 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LoxP28301 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LoxP28301 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LoxP28301 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LoxP28301 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LoxP28301 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LoxP28301 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LoxP28301 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LoxP28301 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LoxP28301 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LoxP28301 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LoxP28301 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LoxP28301 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LoxP28301 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LoxP28301 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LoxP28301 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LoxP28301 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LoxP28301 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LoxP28301 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LoxP28301 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LoxP28301 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LoxP28301 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LoxP28301 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LoxP28301 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LoxP28301 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LoxP28301 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LoxP28301 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LoxP28301 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LoxP28301 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LoxP28301 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LoxP28301 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LoxP28301 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LoxP28301 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LoxP28301 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LoxP28301 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LoxP28301 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LoxP28301 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LoxP28301 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LoxP28301 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LoxP28301 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LoxP28301 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LoxP28301 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LoxP28301 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LoxP28301 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LoxP28301 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LoxP28301 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LoxP28301 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LoxP28301 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LoxP28301 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LoxP28301 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LoxP28301 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LoxP28301 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LoxP28301 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LoxP28301 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LoxP28301 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LoxP28301 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LoxP28301 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LoxP28301 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LoxP28301 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LoxP28301 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LoxP28301 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LoxP28301 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LoxP28301 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LoxP28301 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LoxP28301 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms