Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CenpbP27790 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CenpbP27790 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CenpbP27790 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CenpbP27790 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CenpbP27790 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CenpbP27790 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CenpbP27790 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CenpbP27790 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms