Protein–RNA interactions for Protein: P26516

Psmd7, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd7P26516 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmd7P26516 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmd7P26516 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmd7P26516 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmd7P26516 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmd7P26516 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms