Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmo2P25801 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmo2P25801 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmo2P25801 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmo2P25801 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmo2P25801 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmo2P25801 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmo2P25801 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmo2P25801 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmo2P25801 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmo2P25801 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmo2P25801 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmo2P25801 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmo2P25801 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmo2P25801 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmo2P25801 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmo2P25801 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmo2P25801 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmo2P25801 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmo2P25801 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmo2P25801 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmo2P25801 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmo2P25801 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmo2P25801 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmo2P25801 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmo2P25801 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmo2P25801 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmo2P25801 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmo2P25801 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmo2P25801 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmo2P25801 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmo2P25801 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmo2P25801 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmo2P25801 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmo2P25801 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmo2P25801 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmo2P25801 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmo2P25801 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmo2P25801 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmo2P25801 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms