Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NdnP25233 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NdnP25233 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NdnP25233 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NdnP25233 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NdnP25233 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NdnP25233 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NdnP25233 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NdnP25233 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NdnP25233 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NdnP25233 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NdnP25233 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NdnP25233 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NdnP25233 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NdnP25233 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NdnP25233 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NdnP25233 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NdnP25233 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NdnP25233 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NdnP25233 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NdnP25233 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NdnP25233 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NdnP25233 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NdnP25233 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NdnP25233 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NdnP25233 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NdnP25233 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NdnP25233 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NdnP25233 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NdnP25233 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NdnP25233 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NdnP25233 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NdnP25233 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NdnP25233 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NdnP25233 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NdnP25233 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NdnP25233 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NdnP25233 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NdnP25233 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NdnP25233 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NdnP25233 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NdnP25233 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NdnP25233 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NdnP25233 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NdnP25233 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NdnP25233 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NdnP25233 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NdnP25233 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NdnP25233 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NdnP25233 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NdnP25233 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NdnP25233 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NdnP25233 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NdnP25233 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NdnP25233 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NdnP25233 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NdnP25233 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NdnP25233 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NdnP25233 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NdnP25233 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NdnP25233 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NdnP25233 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NdnP25233 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NdnP25233 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NdnP25233 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NdnP25233 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NdnP25233 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NdnP25233 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NdnP25233 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NdnP25233 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NdnP25233 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NdnP25233 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NdnP25233 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NdnP25233 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NdnP25233 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NdnP25233 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NdnP25233 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NdnP25233 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NdnP25233 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NdnP25233 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NdnP25233 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NdnP25233 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NdnP25233 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NdnP25233 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NdnP25233 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NdnP25233 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NdnP25233 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NdnP25233 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NdnP25233 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NdnP25233 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NdnP25233 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NdnP25233 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NdnP25233 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NdnP25233 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NdnP25233 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NdnP25233 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NdnP25233 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NdnP25233 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NdnP25233 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NdnP25233 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms