Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ggta1P23336 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms