Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxb9P20615 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb9P20615 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms