Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms