Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fcer1aP20489 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms