Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P20040 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P20040 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P20040 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P20040 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P20040 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
P20040 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P20040 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
P20040 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
P20040 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P20040 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
P20040 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
P20040 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P20040 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P20040 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
P20040 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P20040 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P20040 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
P20040 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
P20040 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P20040 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P20040 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P20040 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P20040 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
P20040 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P20040 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
P20040 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
P20040 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
P20040 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
P20040 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P20040 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P20040 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P20040 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P20040 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P20040 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P20040 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
P20040 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
P20040 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
P20040 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P20040 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P20040 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P20040 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
P20040 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P20040 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P20040 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P20040 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P20040 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P20040 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P20040 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P20040 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P20040 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P20040 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P20040 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P20040 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P20040 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P20040 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P20040 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P20040 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P20040 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
P20040 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P20040 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P20040 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P20040 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P20040 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P20040 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P20040 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
P20040 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P20040 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P20040 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P20040 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P20040 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P20040 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P20040 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P20040 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P20040 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P20040 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
P20040 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P20040 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P20040 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P20040 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P20040 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P20040 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P20040 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P20040 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P20040 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P20040 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P20040 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P20040 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P20040 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P20040 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P20040 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P20040 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P20040 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P20040 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P20040 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
P20040 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P20040 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P20040 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P20040 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P20040 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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